Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Ifi35Q9D8C4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Ifi35Q9D8C4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Ifi35Q9D8C4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Ifi35Q9D8C4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Ifi35Q9D8C4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Ifi35Q9D8C4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Ifi35Q9D8C4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Ifi35Q9D8C4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Ifi35Q9D8C4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Ifi35Q9D8C4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Ifi35Q9D8C4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifi35Q9D8C4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi35Q9D8C4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms