Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms