Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms