Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem54Q9D7S1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms