Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms