Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fundc2Q9D6K8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc2Q9D6K8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms