Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms