Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms