Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms