Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms