Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms