Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms