Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D454 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D454 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D454 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D454 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D454 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D454 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D454 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9D454 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9D454 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9D454 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D454 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D454 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D454 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D454 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D454 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D454 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D454 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D454 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D454 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D454 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D454 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D454 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D454 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D454 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D454 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D454 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D454 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D454 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D454 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D454 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D454 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D454 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms