Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms