Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms