Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsig1Q9D2J4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vsig1Q9D2J4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms