Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Batf3Q9D275 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Batf3Q9D275 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms