Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms