Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snu13Q9D0T1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms