Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms