Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed3Q9D0L1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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