Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gtf2e1Q9D0D5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms