Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm8Q9CZR4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm8Q9CZR4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm8Q9CZR4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm8Q9CZR4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm8Q9CZR4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms