Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snf8Q9CZ28 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms