Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdhd3Q9CYW4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hdhd3Q9CYW4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms