Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms