Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps28Q9CY16 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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