Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK4

Slc50a1, Sugar transporter SWEET1, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc50a1Q9CXK4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc50a1Q9CXK4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc50a1Q9CXK4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms