Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sgo1Q9CXH7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sgo1Q9CXH7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sgo1Q9CXH7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sgo1Q9CXH7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sgo1Q9CXH7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sgo1Q9CXH7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sgo1Q9CXH7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Sgo1Q9CXH7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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