Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms