Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms