Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddx28Q9CWT6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms