Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930524J08RikQ9CUJ5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms