Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms