Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms