Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRW3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRW3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRW3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRW3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CRW3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRW3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 602.5 ms