Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5sQ9CRA7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms