Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms