Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR14

Fancl, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanclQ9CR14 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanclQ9CR14 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanclQ9CR14 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanclQ9CR14 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms