Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms