Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms