Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccer1Q9CQL2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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