Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rwdd1Q9CQK7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms