Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms