Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnaseh2cQ9CQ18 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnaseh2cQ9CQ18 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rnaseh2cQ9CQ18 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnaseh2cQ9CQ18 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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