Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc18Q9CQ07 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms