Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms