Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scd3Q99PL7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms