Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim8Q99PJ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms