Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms